DeepMind geeft AI-agent scheikundige vaardigheden voor medicijnen
Google DeepMind bouwde Cheminformatics Skills voor Antigravity. De agent regelt het denkwerk, vaste chemiesoftware doet de berekeningen aan moleculen.
Scheikundigen besteden volgens Google DeepMind nog altijd te veel tijd aan het op orde krijgen van gegevens. Eén molecuul kan in een artikel als naam staan, in een patent als tekening en in een leverancierscatalogus als databestand. Om dat werk uit handen te nemen, heeft DeepMind een set Cheminformatics Skills gebouwd voor Antigravity, Googles omgeving waarin AI-agents zelfstandig taken uitvoeren.
Taalmodel denkt, chemiesoftware rekent
Het belangrijkste ontwerpprincipe is een taakverdeling. Het taalmodel regelt de volgorde van het werk, zoekt in databanken en redeneert over de scheikunde. De berekeningen aan moleculen zelf laat het over aan vaste, voorspelbare software. Daarvoor gebruikt DeepMind RDKit, een bekende opensourcebibliotheek voor chemische berekeningen, plus koppelingen met de openbare databanken ChEMBL en PubChem.
Die scheiding is geen detail. In de scheikunde maakt één verkeerd atoom of één verkeerde binding van een veelbelovend medicijn een heel andere stof. Een taalmodel dat zelf een molecuulstructuur 'verzint', kan zo'n fout ongemerkt maken. Door het rekenwerk bij gespecialiseerde software te leggen, wil DeepMind dat risico verkleinen.
Voorbeeld: een slap molecuul stijver maken
In de uitleg laat DeepMind zien hoe de agent helpt bij een klassieke truc uit de medicijnontwikkeling: een molecuul stijver maken. Veel geneesmiddelen bestaan uit delen die via draaibare bindingen aan elkaar zitten. In oplossing kan zo'n molecuul alle kanten op bewegen, terwijl het voor de werking één vaste vorm moet aannemen. Door een extra binding toe te voegen op de juiste plek, ligt die vorm al vast en werkt het middel vaak sterker.
Als voorbeeld gebruikt DeepMind twee bestaande longkankermedicijnen: crizotinib, met vijf draaibare bindingen, en het latere lorlatinib, waarin die beweeglijkheid grotendeels is weggenomen. De agent moet met dit soort kennis zelf voorstellen doen voor nieuwe, stijvere varianten.
Belofte, nog geen nieuw medicijn
Het gaat om een technische demonstratie, niet om een ontdekking van een nieuw geneesmiddel. Hoe goed de voorstellen van de agent in het lab uitpakken, staat niet in de blog. Eerder liet DeepMind met Antigravity al een agent zoeken naar nieuwe antibacteriële eiwitten, ook toen met de kanttekening dat het lab het laatste woord heeft. De lijn is duidelijk: Google wil Antigravity neerzetten als werkbank voor onderzoekers, waarin AI het zoek- en sorteerwerk doet en de wetenschapper de hypotheses bedenkt.
Bron: Agentic cheminformatics with Google Antigravity (Google DeepMind). Met AI geschreven; zie ons redactiebeleid.